岸信介の時代からなので、推測が正解でないかもしれませんが、自民党の中枢深くにカルトが浸透したのは、政権を民主党に取られたことが拍車をかけたのではないでしょうか？
与党と野党の圧倒的な扱いの違いを経験して、何としても与党になり政権にしがみつくようになったのだと思います。
そのためには選挙に勝つことが必須です。
票を固めるためにはカルトでも何でも使いたかったのでしょう。
なので考えられなかった公明党と組んで創価学会の票も必要としたのでしょう。
節操がないですね。