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『脱原発やTＰＰ反対などで、集会に参加しただけでも「テロリスト」に認定されるおそれがあるのです。
すでに、官邸前デモに参加した人が、公安警察と思われる人物に、自宅まで露骨に尾行されたり、自宅周辺で聞き込みをされた人もいるようです』のは、たぶんその人々が反政府過激分子となり得ると予想されたからでしょう。
街頭デモと言うのは、主張がどんなものでも、きっかけがあると市民生活に影響を及ぼすような暴力を起こす可能性があるからでしょう。中東や北アフリカなどで起きている暴力行為は望ましくありません。

上記の他に「一般市民も標的になっていると考えるべき」理由がありますか、あったら具体的に示してください。「自分の考えを発言できない、強権政治が始まる」と考える理由も不明です。私は全く違う印象を持っています。

「とんでもない意見が出ていました」というご意見ですが、どこが「とんでもない」のかな？