>>政権が学問の自由、言論の自由、思想の自由を奪ってはならないと憲法に書いてあり、こちらが優先することは明白です。

学術会議の議員を任命権者である総理大臣が任命拒否することが、なぜ学問の自由、言論の自由、思想の自由を奪うことになるのか。そもそも誰の自由が奪われたのか。奪われた証拠はあるのか。これが明白でないからもめている。
鳩山氏のような知的レベルの低いヒトはしょうがないが、政府に反対する側は、ここをそれなりに説明しないと、鳩山氏と同じでしょうね。