ゲリラを殺す云々の部分は集団的自衛権を抜きにしても、自衛隊が警護を可能とする(＝警察権)決定を派遣時にしてさえいれば、何も問題はない。
テロやゲリラが襲ってきた場合に、自身或いは警護対象を守るために攻撃するのは憲法が禁ずるがところの国際紛争を解決するための手段としての武力行使には全く当てはまらないよ。
武力の行使じゃなくて「武器の使用」だからね。警察官が犯人を射殺できるのと一緒。

まぁ、警察官が誤って無関係の人間を殺してしまったなら議論の余地もあるが、半分民間人であろうと武器を持ちゲリラとして活動しているならば、それは既に無関係な一般人ではないので殺しても問題はない。