巨大隕石群が地球に近付いている。このままでは地球が滅亡してしまう！ 地球を守れるのは、響子・彩日花・みらいと言う３人の少女だけ。 謎の組織の美女小夜は、上司の命により半信半疑のままアイドル候補生として３人を集める。 アイドルになる気満々の３人であったが、連れてこられた先はゲームセンターで……。

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あれから数年の時が流れ、地球には平和が訪れ、クレーンゲールは、新しくマネージャーとなった時子の手腕で、次々とヒットを飛ばし、不動の世界的アイドルに成長していた。 宇宙ステーションでは、熱気にあふれたライブが開催され、クレーンゲールの人気は確固たるものになっていた。 そのころ、ダークゴリラの惑星では、小夜がある思惑を持って懸命に3人組アイドルユニット「ダークチェリー」を育て上げていた。 それに満足したダークゴリラは、人口惑星ダークスターに小夜と「ダークチェリー」を乗せ、再び地球征服のため急接近する。 「ダークチェリー」のために開発されたクレーンゲーム機は、宇宙空間でアイドル用ステージに早変わりにし、その姿をクレーンゲールの前に現す。 再び、地球を守るミッションを負う「クレーンゲール」の3人。しかし、対峙したのはダークゴリラではなく、3人の少女。自分たちと同じアイドルたち。 戦うことに疑問を感じながらも迎撃するクレーンゲール。 クレーンゲールを宇宙アイドルにするために改良が加えられていた伝説のクレーンゲーム機“クリスタル”が再びその姿を現し、宇宙空間に放たれるとアイドル用ステージへとトランスフォームする。 容赦なくダークゴリラにより地球攻撃の指令が下される。 ここに再び、地球の存亡を賭けたアイドル対決がはじまる。