定年間際で機動捜査隊（通称：機捜）に配属された一見さえないただのオッサンだが、実は指名⼿配800人の顔を覚える見当たり捜査のレジェンド・縞長省一（中村梅雀）と、縞長とバディを組み捜査一課に異動を夢見る上昇志向のイケメン隊員・高丸卓也（平岡祐太）。そして高い洞察力を持ち、時にはスタンドプレーも辞さず事件の裏にある真実を追求し解明していく、警視庁強行犯係の刑事・樋口顕（内藤剛志）。⽇々起こる難事件を機動捜査隊が痛快に解決しながら、シーズンを通して機捜バディと樋口班メンバーがタッグを組み、警視庁最悪のコールドケースに挑む

奥多摩・水根に駐在する警察官・江波敦史(寺島進)は、かつて警視庁捜査一課の刑事として活躍していた。しかし担当事件の取調べ中、重要参考人の中瀬由紀子（杉本彩）が服毒自殺したことで左遷されることに。赴任してから４度目の夏。今や地元では“駐在さん”と呼ばれ慕われている。 ある夕方、江波は山岳ガイド・池原孝夫（鈴之助）に呼び出され、奥多摩山岳ガイドセンターへ。登山道具がなくなってしまったという。盗んだのは合宿に来ている少年山岳会の三田浩樹（小林喜日）だった。大人でも過酷な槍ヶ岳のクラシックルートを登りたくて持ち出したと江波に打ち明けるが、そこにはある理由が…。 駐在所では、老舗旅館の女将・池原美也子（市毛良枝）と、アウトドア用品メーカーのサンレイ副社長・羽川雄一（飯田基祐）が、江波の帰りを待っていた。宿泊客の権藤則夫（大浦龍宇一）が森から帰ってこないという。サンレイでは、水根で “サンレイの森”というレジャースポットを作る大規模計画が進行中で、権藤はその計画責任者。だが早速森へ向かった３人が発見したのは、権藤の撲殺体だった。