西暦2062年。労働力の大幅な自動化プロジェクトの失敗後、その中核となる人工知能アルテミスが人類との戦いを選んだ末、荒廃した二十年後の地球。とある基地の地下研究施設で、ひとりの少女、エンプレスが目覚める。彼女は人類の守護者３人の生き残りのうちのひとりであった。しかし彼女には以前の記憶がない。そんなエンプレスに平和構築軍の大佐は告げる。エンプレスには、現在、アルテミスが建設中の月と地球を結ぶ軌道エレベーターを完成前に破壊する使命があることを。完成すれば月で大量生産中の巨大機械軍が大挙して地球へやってくるからだ。だが、その行く手を仲間であったはずのデッドマスターやストレングス、アルテミスの手先である無人軍隊やカルト集団＜教育機関＞のスマイリーらが阻もうとする。さまざまな思惑が交差する中、大佐らと軌道エレベーターを目指して進んでいくエンプレス。その先で待ち受けるものとは……。

人気シリーズの劇場版。学園都市製宇宙エレベーター『エンデュミオン』。その完成を目前に控えたある日、上条とインデックスは鳴護アリサと出会う。三人で放課後を楽しんでいた時、魔術師を引き連れたステイルが突如襲いかかってくる。そのターゲットはアリサだった。魔術サイドの強襲を受け、学園都市側は女リーダー・シャットアウラ率いる秩序維持部隊を展開する。上条たちを取り巻く状況が混迷を極める中、ステイルは、こう言う。「そこの彼女は、魔術サイドと科学サイドの間で戦争を引き起こしかねない」と――。

1stシーズン 第三次流砂現象によりその一部が泥濘に沈んだ東京。 復興作業用に作られた、高出力・強化装甲を使った犯罪の増加に対処すべく、 警察庁警備局は、その吉祥寺分室に第五特別公安課第三機動強襲室第八係──通称を新設した。 様々な法的制約としがらみに縛られながら、知恵と勇気と口八丁で凶悪事件に挑む若者達（一部を除く）！　決裁完了、出動せよ!! 2ndシーズン サミット開催に向けた「宇宙エレベータープロジェクト」が急ピッチで進む、首都・東京。 強化装甲＜ウィルウェア＞を使った犯罪に対処すべく創設された、警察庁警備局第五特別公安課第三機動強襲室第八係――通称＜ダイハチ＞は、 ロゴスによるテロから日本を救ったことで、今や日本中の注目を集める存在となっていた。 しかしウィルウェアを悪用した犯罪は、その後もエスカレートする一方……。 新メンバーを迎えた黒騎たちダイハチの面々は、今日も知恵と勇気と口八丁、そして民間警察の協力を得て凶悪事件に挑む！決裁完了、 出動せよ！！