全人類が、謎の現象により一瞬で石化して数千年——。 超人的な頭脳を持つ、根っからの科学少年・千空が目覚めた。 文明が滅んだ石の世界を前に、 千空は、科学の力で世界を取り戻すことを決意。 新たな仲間を集め『科学王国』をつくりあげる。 火、鉄、電気、ガラス、ケータイ…… 石器時代から現代文明まで、科学史200万年を駆け上がる千空たち。 しかし、そこへ霊長類最強の高校生・獅子王司が率いる『武力帝国』が 立ちはだかる。 人類浄化を目指す司は、強大な武力によって、科学の発展を 阻止しようとするのだったー STONE WARS、いざ開戦！

司帝国との戦いが終わり、コールドスリープした司を救うべく動き出した千空たち。 石化現象の謎を突き止める為、ついに科学王国は地球の裏側・新世界を目指す！ 航海に向けて船造りを始めた千空たちは、航海力100億の神腕船長を仲間にしようと、記 者だった南の情報をもとに、七海財閥の御曹司で、かつて帆船を乗り回していた男“七海龍 水”を目覚めさせる。 「はっはー！世界は再び俺の物だ‼」と豪語する龍水は、その圧倒的な強欲さで村に通貨を 作り、ゴージャスな暮らしを満喫。船長を引き受ける代わりに、資源の王様“石油”が欲し いと提案するが…？

全人類が、謎の現象により一瞬で石化して数千年――。 超人的な頭脳を持つ、根っからの科学少年・千空が目覚めた。 文明が滅んだ石の世界＜ストーンワールド＞を前に、 千空は、科学の力で世界を取り戻すことを決意。 新たな仲間を集め『科学王国』を作りあげる。 しかし、そこへ霊長類最強の高校生・獅子王司率いる 『武力帝国』が立ちはだかる。 人類の浄化を目指し、強大な武力によって科学の発展を阻止しようとする司。 科学vs武力の戦いは激闘の末、千空たち科学王国が優勢となり、 両国は遂に和解する。 仲間の謀反によってコールドスリープ状態になった司、 そして、全人類を復活すべく、 科学王国は石化光線の発生源、地球の裏側・新世界を目指す！ 世界に飛び出て石化の謎を解き明かす！ 石の世界＜ストーンワールド＞大航海時代がついに開幕する――‼