惑星クレイから“使徒”を名乗るディフライダーたちが地球に降り立った。 全てを滅ぼす“破壊の竜神ギーゼ”。 その復活を目論む“使徒”たちは、 ギーゼが生み出した6体の竜“ゼロスドラゴン”の力を使い地球を侵略する！ ヴァンガードファイターたちよ、今こそ立ち上がれ。 互いに繋ぐ絆のもとに、運命を超えて、未来をつかめ！

トライスリーの物語はNEXTへ 若きヴァンガードファイター達が集う 超大型大会U20チャンピオンシップが開催! 高校生になったトライスリーの新導クロノ、綺場シオン、安城トコハは それぞれの未来を掴む為に別々のチームを結成し、 U20チャンピオンシップでライバルとして激突する!

「カードファイト!! ヴァンガード」 世界で数億人ものプレイヤーを数えるこのカードゲームは、 常に人々を熱狂させ、多くの絆を育んできた…… 孤独だった「新導クロノ」の運命は、未知のクラン《ギアクロニクル》を通じてヴァンガードと出会ったことから大きく動き出した。 誇り高く、自身の可能性を追求する「綺場シオン」 ありのままの自分を認め、健やかに未来を描こうとする「安城トコハ」 彼らチーム・トライスリーは、自分たちの信じるヴァンガードを貫き、共に成長してきた。 そしてこの秋、 ヴァンガード普及協会が主催する超ビッグイベント、「Ｇクエスト」が開幕を迎える。 ６つの支部クエストを制覇した者に与えられる栄誉、「ジェネレーションマスター」の称号とクランリーダーへのチャンス。 新たな目標に燃えるトライスリーだが、その熱狂の裏では、 ヴァンガードを破滅へと導く巨大な陰謀が進行していた…。 己が使命のため暗躍する伊吹コウジの「Plan-G」なる作戦とは？ 新たなる出会いを通じて、クロノたちはどんな未来を掴むのか！？ Ｇクエストには櫂トシキや雀ヶ森レン、蒼龍レオンといったレジェンド級のファイターたちも参戦！ 新時代の戦いが今、始まる！

ある日、「新導クロノ」が中学校に登校すると、下駄箱に中に一枚の地図と共に、初めて目にするカードの束が入っていた。不思議に思ったクロノはそのカードが何かを知るべく、地図に記された場所へと向かう。 するとそこは「カードキャピタル２号店」という名のカードショップで、葛木カムイという店員がファイトをしていた。カムイにカードの事を調べてもらうと、そのカードは「ヴァンガード」と呼ばれるカードゲームのもので、「ギアクロニクル」というまったく未知の種類(クラン)のものだという。 ギアクロ二クルを手に、ヴァンガードの世界へと飛び込んでいくクロノ。その中でギアクロニクルに隠された秘密、そしてクロノが背負う運命が明らかになっていく…！ ヴァンガードを通して出会う「綺場シオン」や「安城トコハ」といったライバルたちと共に、新導クロノの運命が大きく動き始める！！