>>3
MikuMikuDanceがジャンルカテゴリなのかどうかはわかりません
ただ、>>2さんが一番言いたいのはおそらく既存のタグ「MMD」がカテゴリタグ化すると、このページのQ4の説明通りならBlenderとかの他のソフトも「MMD」タグが付けられてしまい、従来通り「MikuMikuDance」の動画を探そうとしても他のソフトが入ってうまくいかなくなる可能性があるので、タグ「MikuMikuDance」を付けてほしいということではないかなと思います
この辺りは生放送で説明がないとおそらく混乱してしまうのでは…

>>4
トップページの項目にもう「トレンドタグ」という類似した機能があるので、それをいろんなところに配置したりとか、計算期間を長くして表示の入れ替えを遅くしてみるとかするとより機能するかもしれません
ただ、トレンドタグをそのままカテゴリタグ化すると、例えば動画投稿数の多い「ゆっくりTRPG」や「クトゥルフ神話TRPG」はカテゴリタグになりますが、投稿数が若干少なめだけど2つをまとめることができる「TRPG」はカテゴリタグにならない、ということにもなりかねないです