消毒＝悪・・・とまでは仰られていませんが、少なかれば良いというのは誤りです。
リンゴ等に使用する薬剤の種類、使用時期、量、更には溶媒として使用のできる水（水道水やその辺りの川の水はNG）までもが事細かに決まっています。それを意図的に減らしているということは・・・
農家の方は毎度毎度薬剤を全身に浴びながら消毒をしていても長生きをしていらっしゃる方が多いです。もし気になるようでしたらリンゴに使用をする薬剤はすべて水溶性なので、よくお水で洗って布で拭き取るといいと思います。表面にテカりが出てより美味しそうにもなりますよ！