『99.9％除菌　なぜ0.1％残した』

これについては、ちゃんと理由があるけどね。
100％（厳密に言うと｢微生物の生存確率100万分の1以下｣）であれば
「滅菌」の用語が使用できるけど、それに満たないから「除菌」。
除菌に分類される製品である以上、100％は謳えない。

滅菌を標榜している製品って、手当て用のガーゼとか
災害時用などの密封哺乳瓶とか、結構限られている。
だから、洗剤とか除菌用品とか
劇的に菌が取り除かれているように見える模式図のCMでも、
よく見ると必ず少しだけ取りこぼしが描かれてるよ。