たぶん、それは可能ですね。
AviSynthでCSVのパースをさせるのは大変そうなので、わざわざCSVにする必要はなくて、GUI側で普通にスクリプトを自動生成すればいだけです。（そういうタイプのソフトもあった気がします）

ちなみに、AviSynthにはフレーム単位でエフェクトのパラメータを変化させるAnimate関数というものがあります。
あと確かeval的な物も使えたはずなので、動的にスクリプトを生成して云々の処理も可能なはずです。（さらにいえば、JavaScriptを組み込めるプラグインもあります）