自営業ゆえ、わかりみが深い
税理士さんを入れても、領収書の管理・計上は自分でやらないといけないですし
法人でもない現状で「経理事務員を雇う」というのも難しいと思います
領収書は日締めが望ましいですが最悪でも週締めを心がけましょう

交通費を経費にするにも仕事の依頼が有った事を明確にしないとキツく
ドグマさんの交通費支給はある意味でお互いの事務作業の軽減にもなりますね

あとは、家計簿アプリに大枠で入力しておいてから
E-tax対応の経理アプリに入力しなおすと結構楽です

他には年1万かかりますが、個人向けの経理アプリもお勧め
freee株式会社 https://www.freee.co.jp/kojin/
もちろんE-tax対応の手堅いアプリです
レシート・領収書をスマホで撮るだけで記録してくれます
見間違いを防げるのでこの機能だけでも価値がありますよ
うちは法人版を利用しています、個人版でもそんなに差異はないはず