天皇陛下万歳がいまどき難しいのは、天皇陛下が戦争につながるという軍国主義的な感情を示すアイコンだからでしょう。
そうしたのは間違いなく戦後の教育、社会などの風潮（マスコミ）だとは思います。

天皇陛下万歳は過去の日本における、天皇のあり方を示す言葉であり、天皇＝日本的な考え方の代表でもあることを考えると、
過去においては天皇陛下万歳は日本を愛するという意味でもあったかもしれませんが、戦後の教育、社会などの風潮（マスコミ）によって現在においては天皇陛下という戦争を思い起こさせるものを声高に言うということになるのだと思います。

国を愛していないなんてことは、いまどきの人でもないと思いますよ。そのほかの国の実情などを聞いたうえで今の日本を嫌うかどうか聞けばほぼ日本を選ぶと思うし、日本を代表する文化をどれかにこだわりを持たない人はまずいない。（例えば桜を嫌う若者がいないのは、昨今の桜関連ヒット曲が卒業入学シーズンに流れることを考えればわかる）
そのことを指摘されれば、誰でも自分が日本人であることを自覚するだろうし、それを誇りに思うと思います。

ただ、上記のような感情を刷り込まれているのが現状なので天皇は別とらえる人は多いでしょう。
でも天皇陛下イコール軍国主義イコール戦争なんて実に浅はかでくだらない連想。過去の出来事を教訓として教えるのはいいけど、感情的刷り込みは間違っていると思います。
なぜなら三つのどれも、現在の陛下には全くあてはまりません。陛下の言動や行動、姿を見てどこに軍国主義を見るのか、戦争を予感させるのか全くわかりませんね。
天皇陛下は日本の象徴であり、日本国民全員の代表でもあるわけだし、そんな方を見てありがたく感じるのは日本人なら当然だと思います。