午前０時にだけアクセスできる「地獄通信」。 ここに晴らせぬ怨みを書き込むと、地獄少女が現れて憎い相手を地獄に落としてくれる……。 若者たちの間で広がった都市伝説のような噂だったが、実は本当の事だったのだ。 少女の名前は、閻魔あい。 依頼主の怨みの感情に共鳴した時、彼女は地獄少女として標的となった人間を地獄へと送り流す。 ……だがそこには伝説には語られていない、少女との契約が存在した。 「人を呪わば穴二つ。相手を地獄に送る代わりに、あなたの魂も死後地獄に行く事になるわ、それでもいいの？」 そして、ある時閻魔あいの前に、謎の少女・ミチルが姿を現すようになる。 自分が誰なのか、なぜここにいるのかを思い出せない様子のミチルに、あいは語りかける。 彼女は一体何者なのか？ その秘められた過去を紐解いてゆく――。

度重なる増築により迷路のように入り組んだ 私立誠教学園。 中等部一年の新谷貞一（にいや ていいち） はある日、旧校舎で迷い偶然たどりついた部 屋で、不思議な雰囲気を纏う少女・庚夕子 （かのえ ゆうこ）と出会う。 彼女は自分を“旧校舎の幽霊”だと言う。 自分の過去を思い出せない夕子の為、貞一と 夕子は「怪異調査部」を立ち上げ、この学園 で語り継がれる数々の怪異を解き明かしていく。