「妖怪祓い」とは、本来すむべき「隠世（かくりよ）」から、 何らかの事情で「現世（うつしよ）」に留まる妖怪たちを「隠世」へと送り届ける仕事である。 妖怪祓いを行う物怪庵の主・安倍晴齋への「１００万怨」支払いのため、 奉公人として妖怪祓いの仕事を手伝うことになった芦屋花繪。 ある日、２人が仕事を終えてモノノケ庵に戻ると、隠世を統制する三権神の１人、 立法からのＳＯＳが届く。 ２人はすぐさま隠世を訪れるが、そこで芦屋は事件に巻き込まれることに…。 芦屋と安倍の妖怪祓いコンビと妖怪たちの物語が再び幕を開ける。