時は1582年、所は本能寺。明智光秀の謀反の さなか、織田信長は炎に取りまかれながら、 遮光器土偶にも似た謎の生命体に遭遇する。 時は流れ、現代。修学旅行で台湾に来ていた 女子高生、小椋しお。ミリタリー好きで人付 合いの苦手な彼女はクラスでもちょっと浮い た存在。 その彼女が、突如現われた謎の巨大怪獣〝進 化侵略体〟の襲来に遭遇する。逃げまどう人 びとの中で、しおはE遺伝子（ジーン）ホル ダー〝切り裂きジャック〟が戦う姿を目撃する。 最新鋭の戦闘機や戦車ですら歯が立たない進 化侵略体を追いつめていく切り裂きジャッ ク。しかし、ジャックは隙をつかれて大ピンチ！ もはや為す術がないと思われた時、しおの中 の眠れる織田信長のE遺伝子が目覚めた。