日本をW杯優勝に導く世界一のストライカーを育てるため、 日本フットボール連合は“ブルーロック（青い監獄）”プロジェクトを立ち上げる。 プロジェクトに招待されたのは300人の高校生。 しかも全員FW（フォワード）。 脱落すれば将来、サッカー日本代表へ入る資格を失うという極限状態の中、 選ばれし才能の原石たちは、ストライカーとしてのエゴを次々と覚醒させていく。 時に他人を蹴落とし、時に自らの進化を以て、過酷なセレクションを生き残ったのは35人。 エゴが渦巻く熱狂のサバイバルを乗り越えた彼らは、“ブルーロック（青い監獄）”プロジェクトの存続を賭けて、U-20日本代表との史上最もイカれた大一番(ビッグマッチ)へと挑む！ 今、己のエゴを世界に刻むため、自らの手で運命を変えるため、史上最もアツい戦い（試合）が始まる。

世界一のエゴイストでなければ、世界一のストライカーにはなれない。 日本をW杯優勝に導くストライカーを育てるため、日本フットボール連合はある計画を立ち上げる。 その名も”ブルーロック（青い監獄）”プロジェクト。 集められたのは300人の高校生。 しかも、全員FW（フォワード）。 299人のサッカー生命を犠牲に誕生する、日本サッカーに革命を起こすストライカーとは――？ 今、史上最もアツく、最もイカれたサッカーアニメが開幕する。

U-17Ｗ杯（アンダーセブンティーンワールドカップ）を終え、選手達がそれぞれの日常に戻った頃。氷帝では、部長を引き継いだ日吉を中心に２年生の鳳、樺地達が部を動かし、３年生は彼らを見守っていた。そんな中、跡部財閥が湘南にテニスコートを新設。エキシビジョンマッチにもっともふさわしい対戦校を跡部が指名する。相手は――立海大附属中。 全国大会の辛苦を胸に、王者として…ではなく挑戦者（チャレンジャー）として新たに決意を燃やす彼らは、切原ら次代の立海にその想いを引き継ぐため、跡部の挑戦を引き受ける。前大会で対することの叶わなかった氷帝と立海。中学最後の試合となる３年生、そして未来を背負っていく２年生。それぞれの想いが交わう夢のゲームが始まる…!!

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