時は近未来――2040年の日本・東京。 ある難病に侵された青年・怜人は幼なじみの絵理沙と再開を誓い、 病を治すため“コールドスリープ”することに。 5年後に目を醒ますと、世界は大きな変貌を遂げていた。 MK(Male Killer）ウイルスによって地球上の99.9％の男性が死滅。 地上波5人の男に対して50億の女性が存在する、超ハーレムとなっていた。 MKウイルスへの抵抗力を持つ男性“ナンバーズ”は、わずか5人。 その1人である怜人は、残された女性たちと人類の存続のため “メイティング”することを求められる。 パンデミック後の世界に待っていたハーレム生活。 同時に、怜人はナンバーズを巡る世界的な陰謀に巻き込まれていく。 押し寄せる誘惑を乗り越え、世界を救うことはできるのか。

ここは何度目かの黄昏を迎え、緩やかに終わ りの時を迎えつつある世界。 主人公のエスカはその世界の辺境の小さな街 「コルセイト」に住んでいる少女。 母親譲りの古い錬金術を使い人々の役に立ち たいと頑張っていたところ、 コルセイト開発班に正式に役人として配属さ れることになった。 また同じタイミングで、「中央」で最新式の 錬金術を学んでいた青年ロジーが派遣されて くる。 開発班で出会った二人は、協力して開発班と コルセイトの街をもり立てていこうと約束する。 錬金術が紡ぐ、少女と青年の物語。

A.D.2199 Dec 一年の締め括り、街は新年への期待で活気づ いていた。 そんな最中をＳＳ級の統制機構反逆者にして 史上最高額の賞金首、 「ラグナ＝ザ＝ブラッドエッジ」が第十三階 層都市「カグツチ」に出現したという 情報が走り抜ける。 対象「ラグナ＝ザ＝ブラッドエッジ」は別名 「死神」と称され、その行動目的 は統制機構の壊滅とわれている。 対象に懸けられた高額な賞金や彼の所有する 絶対無比の力を持つ魔道書を狙い、 様々な者達がここ第十三階層都市「カグツ チ」に集結する。

朝起きて、学校に行き、放課後は友達と過ご す。楽しいことも、悲しいことも、親友と一 緒に体験する。そんな、ずっと続くと思って いたあたりまえの毎日に、運命のいたずらが やって来た。それはまだ中学生の彼らには受 け入れるしかない出来事で…。 そんなとき、あらがえない定めを前に、ひと 夏のキセキが舞い降りる。 これは、下田の町で育った４人の少女の物 語。暑くてさわやかな夏色キセキがきっとあ なたを包み込む…。