エインズワースとの激闘からひと時の休息。 美遊を救出したイリヤたちは、平行世界の衛宮士郎から美遊の過去、 この世界で起きた聖杯戦争のことを知らされる。 それは美遊の悲しい運命であり、美遊のために兄・士郎が 命を賭して歩んだ壮絶な戦いの物語だった。 人類の救済のために美遊を犠牲にするエインズワース。 美遊のために世界の敵となると決めた士郎。 相容れない２つの正義に、すべてを守ると誓うイリヤ。 「助けるよ。私はみんなが助かる道を探すって決めたから！」 大切な人たちと笑いあえる明日を作るために――。 魔法少女たちの戦いが、再びはじまる……！

「話をしようと思う。俺と、美遊の……これまでの話を」 世界は滅びに向かって進んでいた。その歩みを止められるのは、〝聖杯〟たる美遊の犠牲のみ。世界か、美遊か——。 〝世界の救済〟を掲げるエインズワースが突きつけられた問いに対し、イリヤが出した答えは、両方救うという単純な〝ワガママ〟だった。 戦いは小休止を迎え、一行は美遊と士郎が育った家に身を寄せる。団らんのなか、士郎は、美遊との過去を話し始めた。あらゆる願いを無差別に叶える神稚児だった美遊。 士郎は、切嗣と暮らしていた家に、身寄りのない彼女を引き取った。それから、5年。二人は本当の兄妹のように平穏な暮らしを送ってきた。 しかし、そんな日常は突如として終わりを告げる。美遊の生家へと訪れた二人。その前に、美遊を“奇跡”として希求する樹里庵が姿を現し——。 美遊と士郎、エインズワースの因縁が、ここに語られる。

プリズマ☆イリヤ オールキャスト総出演のドタバタギャグコメディがここに開幕！ 「Fate/kaleid liner プリズマ☆イリヤ」シリーズのキャラクターが平行世界の垣根を越えて大集合！ 原作ひろやまひろし監修による完全新作オリジナルエピソード。 少女たちのもう一つの物語が描かれるー。

とある夜、バスルームに飛び込んできたマジカルルビーの、軽妙かつ巧妙なトークに騙されて、魔法少女になってしまったイリヤ。 ルビーの元の持ち主である凛に言われるがままに”クラスカード”を回収することに。 ライバル(？)であるもう一人の魔法少女、美遊とともに、傷つき、すれ違いながらも、ハードなバトルを戦い抜いてどうにか7枚のクラスカードを回収。 イリヤたちは平穏な日常に戻ることができた。 そして―――。 回収任務が終わってから数週間後、凛たちから新たな任務を命じられるイリヤと美遊。 地脈に魔力を流し込んで安定させるだけという簡単な任務のはずだったのだが、なにが悪かったのかトラブルが発生！ それが新たな物語の始まりだった―――。

「こういう時間がいつまでも続けばいいのに――」。8枚目のクラスカードに宿る英霊との激闘を終えたイリヤたち。残り少ない夏休みをめいっぱい楽しもうと再びバカンスモードに♪しかし、そんな日常は、あまりにもあっけなく打ち破られてしまう。異変の起こった円蔵山に駆けつけたイリヤたちの前に現われる現実離れした人影。突然の交戦の後、空間が揺らぐ。そして、動きの後、イリヤが目覚めたのは、真冬の冬木市――平行世界。そこは、美遊が生まれ、育った世界だった。大切なものはすべて守る――。魔法少女の、普通にして壮大な願いを叶える戦いが今始まる！

Fate＜運命＞に巻き込まれた少女たちの物語は遂に夏休みに突入⁉ 海! 水着! 誕生日! 魔法少女たちの日常（⁉）はこれからが本番!!

冬木市の穂群原学園初等部に通うイリヤ（イリヤスフィール・フォン・アインツベルン）は、義理の 兄に淡い恋心を抱いているごくごくフツー（?）の女の子。しかしある晩、空からお風呂場に乱入して きた魔法のステッキ マジカルルビーに言葉巧みに騙され、強制契約を結ばされてしまう。 魔法少女プリズマ☆イリヤとなったイリヤは、ステッキの元持ち主 遠坂凛には「私の代わりに戦いな さい」と命じられる始末。冬木市に眠るという、英霊の宿るカードの回収をする二人の前に、美遊と 名乗る謎の美少女が現れて･･･。はたしてイリヤは全てのカードを回収し、冬木市を救うことができる のか･･･!?

とある古びた一軒家で一人暮らしをしている 高校生・夜知春亮。ある夜、台所からの怪し い気配に目を覚ましてみると、そこにいたの は全裸の煎餅泥棒女で!?フィアと名乗るその 少女曰く、自分は「呪われた道具」であり、 その呪いを解くために夜知家を訪れたとい う。呪いを受けつけない体質の春亮は押しか け気味なその少女と同居することになる が・・・。