不殺を誓う流浪人・緋村剣心は、明治11年、東京で神谷薫と出会う。 ニセ抜刀斎事件が縁で神谷道場に居候することになったが、御庭番衆や刃衛など幕末を生きた修羅たちが次々と剣心に襲いかかり…!?

“神の国”建国をもくろむ天草翔伍、勝海舟の命を狙う紅葵、神秘の霊薬で世界征服の野望を抱く黒騎士団。 東京壊滅計画を企てる水一族・霊水との死闘を描いた、ＴＶ版オリジナル４大ストーリー。

国盗りをもくろむ志々雄真実が動き始めた!!　剣心たちは志々雄一派を阻止するべく京都へ向かう。 一方、最強の剣客たち・十本刀が志々雄の元に集結！　激動の京都を舞台に今、決闘の幕が開く!!

激闘の日々から15年。 剣心は山県有朋に懇望され、戦が勃発した大陸へ渡っていた。 剣客生命はすでに絶たれ、そのうえ不治の病に苦悶する剣心。 最後の力をふり絞り、最愛の妻・薫の待つ日本へ…。