価値観の多様化がさらに進んだ2035年。高校へ行くことがあたりまえでなくなった時代…。 少子化が進み、生徒数の減少から廃校の危機に立たされる学校も多くなっていた。 そんな活気を無くした学校のひとつ「私立聖桜学園」に、一人の転校生が現れる。 転校生の名は天宮学美（通称：まなび）。元気少女のまなびは、聖桜学園にどんな旋風を巻き起こすのか！？

英国・ウェールズの魔法学校を卒業し、魔法使い見習いとなった10歳の少年ネギ・スプリングフィールド。 彼は、父親のような最上級の魔法使い「マギステル・マギ」になりたいと願い、日本にある麻帆良学園へと修行のために派遣されることになった。 生徒数３万人以上、広大な敷地内に大学から幼稚園までのあらゆる教育施設、 さらには学生寮、病院、レストラン、巨大アーケードまで、なんでも揃っている巨大学園都市・麻帆良学園。 その女子中等部２年Ａ組の担任になったネギだが、さっそくクラスの女の子から「お子ちゃま先生」と、先生の威厳もなく子供扱い。 それどころか、魔法使いであるとバレると厳罰となってしまうにもかかわらず、初日からいきなり自分のクラスの生徒である神楽坂明日菜に、 魔法使いであると感づかれそうになったり、空き部屋がないからと、女子寮にある明日菜と近衛木乃香と相部屋になったりと苦労の連続！ さらに謎のドラキュラ事件も勃発。生徒のために戦うことになったネギ先生だが、彼らの信頼を得ることができるのか？　そして、この修行を乗り越え、 父親のような「マギステル・マギ」へと辿り着くことができるのか？

時は2070年、日本に侵略兵器と思われる謎の 巨大物体が出現。それを追い払ったのは、こ れも謎の巨人でした。 そんな事件があった直後に、天網（てんも う）市の御統（みすまる）中学に、統原無量 （スバル・ムリョウ）が転校してきます。 彼は、この時代には珍しい学生服を着た、不 思議な雰囲気の男の子です。 そして、彼と知り合った事から、ごく普通の 男子中学生、村田始は宇宙規模の大きな事件 に巻き込まれていくのでした。

ある日、東方院行人は、父親とのケンカを キッカケに、勢いで家出をしてしまった。 船に乗り込んだまでは良かったが、うっかり 船から転落。 100年に一度級の大嵐に遭い、数日間の漂流 の末、ここ"藍蘭島"に辿り着いた。 でも、この島、ちょっとヘン。･･･というの も、この藍蘭島は、女の子だけの島だった！！ 行人を待ち受けていた、うらやましすぎる （？）運命。 ―これは、島で唯一の少年のハプニングだら けの記録である。

一年中枯れない桜の木に、雪が舞い降りる頃。 桜内義之は、かつて気持がすれ違ってしまっ た月島小恋と、良きクラスメイトとして笑顔 で言葉を交わせるようになっていた。 そんな彼女とともに風見学園で行われるクリ スマスパーティーの準備に励みながら、義之 は朝倉音姫や朝倉由夢と新たな物語を紡ぎだす。 それは、幸せと希望に満ちた未来へと進む物語。 だが一方で、芳及さくらはある異変に気付 き、ひとり表情を曇らせていた。どんなに温 かい夢もいつかは覚める。それはわかってい たはずなのに……。 彼女が感じた異変は、義之たちの日常にどん な影響をもたらすのか……？

一年中、桜の花が咲いている初音島。 そこにある風見学園に通う桜内義之は、 学園長・芳及さくらの家で暮らしながら、 学園ではクラスメイトとともに充実した日々 を過ごしていた。 そんな中、ふとしたことから彼の甘く切ない 恋物語が始まる。 家族のような存在である姉妹、朝倉音姫と朝 倉由夢。 幼馴染みの月島小恋に、クラスメイトの雪村杏。 そして、学園のアイドル・白河ななかや、謎 の少女・天枷美夏。 さまざまな少女たちが、義之の物語に花を添 える。 いつまでも変わらない桜の木に見守られながら、 彼の日常が少しずつ変わろうとしていた……。

初音島に、ひとりの少女が降り立った…… 初音島にもうひとつの風が吹いた 初音島に舞い降りた、亜麻色の髪の見習い魔 法少女 初音島でふたたび始まる、もうひとつのエピ ソード 初音島だけに存在していた不思議な現象で あった、花が枯れないはずの桜が枯れてし まってはや二年。主人公・朝倉純一は、風見 学園付属から本 校へ進学し、相変 わらずの学園生活を過ごしていた。あれから 彼の口から「かったるい」の言葉は消え、見 違えるほどはつらつとしていたのだった。友 達である白 河ことり、天枷美 春、水越眞子、杉並といった面々と、いまま でとなにも変わらぬ日常を過ごしている。た たひとつの大きな変化をのぞいて――。 ある日、そんな初音島にひとりの少女がやっ てきた。彼女の名はアイシア。純一の祖母に 魔法を教わるため、はるばる北欧からやって きたのであ る。しかし純一の 祖母はすでに他界してしまっており、アイシ アは唯一の当てを失ってしまう。純一も祖母 から教わった、和菓子を手のひらに生み出す というささ いな魔法を使える ことは確かだが、そこで彼女が選んだ道とは なんと……!?